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Wahrscheinlich war La Gomera schon den Phöniziern bekannt, dies ist jedoch nur eine Vermutung. Für viele Dinge auf La Gomera gibt es keine Belege, diverse Fakten lassen sich nur erahnen. Kulturgeschichtlich sollen die Ureinwohner der Kanarischen Inseln mit den nordafrikanischen Berbern verwandt sein. Damit sie sich auch über längere Strecken verständigen konnten, wurde die sogenannte Pfeifsprache angewendet. Man vermutet, dass der Name La Gomera sich auf den alten Berberstamm Ghomara bezieht. Beweise hierfür gibt es aber auch hierzu nicht.

Die Insel wurde 1404 von den Spaniern erobert. Zu Beginn der Landnahme ergaben sich die Guanchen, aber da sie sich später ungerecht behandelt fühlten, reagierten sie mit Aufständen. Von 1477 bis 1488 herrschte der Graf Hernan Peraza. Dieser hatte nicht den besten Ruf, er galt als sehr grausam. Einheimische haben den Grafen später ermordet. Seine Frau Beatris de Bobadilla folgte ihm wenig später als Machthaberin der Insel. Ihre Macht stützte sich jedoch vor allem auf den Feudalherren von Gran Canaria, Pedro de Vera.